Katedra histórie má medzinárodnú spoluprácu s Univerzitami v Istanbule (Turecko), Velikom Tarnove (Bulharsko), Iasi (Rumunsko) a Ústí nad Labem (ČR), pričom na osobnej báze tu možno počítať aj univerzity v Opave, Brne, Prahe, Grazi, Innsbrucku, Viedni, Frankfurte nad Odrou, Bielefelde, Berlíne, Budapešti, Krakove, Vilniuse, Luxembourgu, Lille, Paríži (Paris-Est, Marne-la-Vallée), Austine (Texas, USA) a New Yorku (City University of New York, USA) ako aj s Centrom pre výskum stredovýchodnej Európy v Lipsku (Nemecko), Wirthovým inštitútom v Edmontone (Kanada), Herderovym inštitútom v Marburgu a Inštitútom Maxa-Plancka vo Frankfurte nad Mohanom (oba Nemecko).